被动转运和主动转运只涉及小分子物质或离子。细胞膜对一些大分子物质或物质团块的转运，则需要通过更复杂的、需代谢供能的膜结构和功能的改变，才能完成跨膜转运。即通过细胞膜的“运动”来完成。称为出胞和入胞（下图）。
见于内分泌细胞和外分泌细胞的分泌，以及神经轴突末梢释放递质。当分泌时，小泡被运送到细胞膜内表面，并与细胞膜融合后，向胞外开口，将全部内容排出。
指大分子物质或物质团块（细菌、病毒、异物、细胞碎片、血浆中的脂蛋白颗粒及大分子营养物质）借助于与细胞膜形成吞噬泡或吞饮泡的方式进入细胞的过程。分别称为吞噬（phagosytosis）和吞饮（pinocytosis）。吞噬主要发生在单核细胞、巨噬细胞等特殊细胞，吞噬泡的直径较大（1~2μm）。吞饮可发生在几乎所有细胞，吞饮泡直径较小（0.1~0.2μm）。吞饮可分为液相入胞(fluid-phase endocytosis)和受体介导入胞( receptor-mediated endocytosis).
液相入胞是细胞本身固有的活动，指细胞外液及所含溶质连续不断地进入细胞内。 受体介导入胞则是通过被转运物质与膜受体特异结合，二者一同凹入细胞内，再分离，细胞膜与受体均可以重复使用（下图）。通过这种方式入胞的物质很多，包括胰岛素及一些多肽类激素、内皮生长因子、神经生长因子、低密度脂蛋白颗粒、结合了铁离子的运铁蛋白、结合了维生素的运输蛋白质、抗体及一些细菌等。它与一般的入胞比较，速度快，特异性高。
